GoogleAppEngineとvirtualenvは相性が悪くて、1.6.0までは、パッチを当てないとエラーになってしまってましたが、1.6.1で修正されたようです。めでたしめでたし
リリースノート
https://docs.google.com/document/pub?id=1AZjOs_it3FwPF5ZjUYsbpntGTbbnPqtl0kGChaPZxok&pli=1
SDK が virtualenv で動かない問題を修正しました。 http://code.google.com/p/googleappengine/issues/detail?id=4339
実際にちゃんと動くことを確認しました。
